История компании ERP-Service начинается с создания филиала «ВЦКП АО «КазТрансОйл», основной задачей которого и по сей день является автоматизация технологических и управленческих процессов, модернизация сетей телекоммуникаций и развития информационных технологий. После успешного внедрения автоматизированной системы управления на базе решений немецкой компании SAP AG в АО «КазТрансОйл», было принято решение на основании решения Координационного Совета по внедрению ERP-систем в АО НК КазМунайГаз о расширении сферы деятельности и создании консалтинговой компании, занимающейся аутсорсингом ERP-систем на предприятиях нефтегазовой отрасли Казахстана.
В связи с этим 16 марта 2005 года был создан филиал «IT-service АО «KazTransCom» - предшественник ныне существующей компании ERP-Service. Большую часть коллектива филиала составили бывшие работники филиала «ВЦКП АО «КазТрансОйл», имеющие опыт внедрения в таких компаниях как АО «Испат-Кармет», АО «Жайремский ГОК», АО «КазТрансОйл», АО «Интергаз Центральная Азия». На базе филиала «IT-service АО «KazTransCom» были реализованы проекты по внедрению и сопровождению ERP-систем в таких компаниях, как АО «КазТрансОйл», АО «КазМунайГаз», АО «Интергаз Центральная Азия», АО «КазТрансГаз», АО «Разведка Добыча «КазМунайГаз».
В августе 2006 года в целях обеспечения престижа, повышения конкурентоспособности и дальнейшего экономического подъема деятельности АО «KazTransCom» было принято решение о создании ТОО «ERP-Service «KazTransCom».
На данный момент компания ERP-Service одна из лидирующих консалтинговых компаний в области информационных технологий в Республике Казахстан.